Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9G9

ZNF449, Zinc finger protein 449, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF449Q6P9G9 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF449Q6P9G9 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms