Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUI2

GPAT2, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT2Q6NUI2 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPAT2Q6NUI2 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms