Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRAMD4Q6IC98 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRAMD4Q6IC98 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRAMD4Q6IC98 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRAMD4Q6IC98 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRAMD4Q6IC98 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.4 ms