Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms