Protein–RNA interactions for Protein: Q6EMB2

TTLL5, Tubulin polyglutamylase TTLL5, humanhuman

Predictions only

Length 1,281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL5Q6EMB2 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms