Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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