Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms