Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms