Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTXN3Q4LDR2 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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