Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF8Q3BBV2 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms