Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms