Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms