Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
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