Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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