Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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ECM1Q16610 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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ECM1Q16610 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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