Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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