Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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SNAPC1Q16533 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
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SNAPC1Q16533 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
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SNAPC1Q16533 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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SNAPC1Q16533 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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SNAPC1Q16533 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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SNAPC1Q16533 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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