Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
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