Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
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SSX1Q16384 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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SSX1Q16384 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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SSX1Q16384 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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SSX1Q16384 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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SSX1Q16384 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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SSX1Q16384 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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SSX1Q16384 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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SSX1Q16384 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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SSX1Q16384 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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SSX1Q16384 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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SSX1Q16384 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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