Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
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NEDD8Q15843 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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NEDD8Q15843 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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NEDD8Q15843 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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NEDD8Q15843 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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