Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 ALMS1P1-201ENST00000428767 921 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 EEF1AKMT3-203ENST00000548256 561 ntTSL 4 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 AC022001.3-201ENST00000606330 596 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 TGM1-202ENST00000544573 1581 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 PEBP1P3-201ENST00000455475 548 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 SMIM15-202ENST00000507416 584 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 BACE1-207ENST00000510630 1236 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 AACSP1-202ENST00000521412 1095 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 SCGB1A1-202ENST00000534397 466 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 AL049542.1-201ENST00000430231 278 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 AC024405.2-201ENST00000528459 810 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 ZFP1-207ENST00000567481 493 ntTSL 4 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 LINC00449-201ENST00000366259 872 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 AL512328.1-203ENST00000428480 673 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 AL954722.1-201ENST00000431238 259 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 AC103563.2-201ENST00000442200 597 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 TSTD1-206ENST00000466967 477 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 AC025419.1-201ENST00000537250 690 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 UCN3-201ENST00000380433 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 HNRNPA1P7-201ENST00000521273 963 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 ZNF720-211ENST00000539915 837 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 PDLIM1P1-201ENST00000604187 969 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 CSAG3-201ENST00000599845 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 LINC01012-203ENST00000628762 743 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RYR3Q15413 CSAG2-203ENST00000638741 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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