Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms