Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms