Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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