Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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