Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TCIRG1Q13488 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
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