Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
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FOXE3Q13461 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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FOXE3Q13461 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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FOXE3Q13461 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
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