Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 SMARCA2-211ENST00000417599 980 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 RFC3P1-201ENST00000454568 682 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 AP000640.1-201ENST00000525337 879 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 AC106733.1-201ENST00000624476 1038 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 AC114982.2-201ENST00000461396 358 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 CARD8-214ENST00000520007 614 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 GPRC5D-AS1-203ENST00000536029 466 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 FAM192A-206ENST00000564108 1055 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 AC079414.3-201ENST00000612986 1090 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms