Protein–RNA interactions for Protein: Q13425

SNTB2, Beta-2-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB2Q13425 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNTB2Q13425 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms