Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM28Q13263 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM28Q13263 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM28Q13263 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM28Q13263 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM28Q13263 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM28Q13263 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM28Q13263 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM28Q13263 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM28Q13263 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM28Q13263 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM28Q13263 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM28Q13263 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM28Q13263 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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