Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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CALCOCO2Q13137 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
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CALCOCO2Q13137 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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CALCOCO2Q13137 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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CALCOCO2Q13137 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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CALCOCO2Q13137 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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CALCOCO2Q13137 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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