Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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