Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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