Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
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PTP4A2Q12974 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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