Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXD4Q12950 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXD4Q12950 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXD4Q12950 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXD4Q12950 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXD4Q12950 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXD4Q12950 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXD4Q12950 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXD4Q12950 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXD4Q12950 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXD4Q12950 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXD4Q12950 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FOXD4Q12950 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXD4Q12950 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXD4Q12950 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXD4Q12950 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXD4Q12950 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXD4Q12950 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXD4Q12950 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXD4Q12950 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FOXD4Q12950 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXD4Q12950 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXD4Q12950 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXD4Q12950 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXD4Q12950 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXD4Q12950 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXD4Q12950 ATL2-204ENST00000406122 2864 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXD4Q12950 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXD4Q12950 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXD4Q12950 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXD4Q12950 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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FOXD4Q12950 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXD4Q12950 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXD4Q12950 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXD4Q12950 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXD4Q12950 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXD4Q12950 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXD4Q12950 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXD4Q12950 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXD4Q12950 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
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FOXD4Q12950 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXD4Q12950 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXD4Q12950 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXD4Q12950 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXD4Q12950 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXD4Q12950 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXD4Q12950 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXD4Q12950 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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FOXD4Q12950 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXD4Q12950 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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FOXD4Q12950 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXD4Q12950 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXD4Q12950 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXD4Q12950 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
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FOXD4Q12950 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXD4Q12950 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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FOXD4Q12950 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXD4Q12950 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FOXD4Q12950 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXD4Q12950 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXD4Q12950 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXD4Q12950 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXD4Q12950 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXD4Q12950 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXD4Q12950 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXD4Q12950 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXD4Q12950 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXD4Q12950 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXD4Q12950 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXD4Q12950 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FOXD4Q12950 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FOXD4Q12950 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FOXD4Q12950 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FOXD4Q12950 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FOXD4Q12950 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FOXD4Q12950 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FOXD4Q12950 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FOXD4Q12950 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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