Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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FOXF1Q12946 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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FOXF1Q12946 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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FOXF1Q12946 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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FOXF1Q12946 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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FOXF1Q12946 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXF1Q12946 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
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