Protein–RNA interactions for Protein: Q04721

NOTCH2, Neurogenic locus notch homolog protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH2Q04721 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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NOTCH2Q04721 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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NOTCH2Q04721 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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NOTCH2Q04721 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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NOTCH2Q04721 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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NOTCH2Q04721 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NOTCH2Q04721 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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