Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms