Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms