Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMARCA2P51531 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms