Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms