Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 FAM9C-202ENST00000380625 1122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATRXP46100 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATRXP46100 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
ATRXP46100 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATRXP46100 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
ATRXP46100 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATRXP46100 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
ATRXP46100 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATRXP46100 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATRXP46100 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATRXP46100 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATRXP46100 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATRXP46100 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATRXP46100 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRXP46100 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRXP46100 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRXP46100 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRXP46100 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRXP46100 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRXP46100 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRXP46100 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRXP46100 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRXP46100 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRXP46100 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRXP46100 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRXP46100 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRXP46100 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRXP46100 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRXP46100 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRXP46100 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRXP46100 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRXP46100 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRXP46100 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRXP46100 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRXP46100 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRXP46100 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRXP46100 AL357833.1-201ENST00000413993 832 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRXP46100 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRXP46100 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRXP46100 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRXP46100 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRXP46100 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRXP46100 KRT17P4-203ENST00000579355 621 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRXP46100 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRXP46100 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRXP46100 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRXP46100 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRXP46100 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRXP46100 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRXP46100 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRXP46100 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRXP46100 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRXP46100 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRXP46100 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRXP46100 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRXP46100 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRXP46100 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRXP46100 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRXP46100 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRXP46100 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRXP46100 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRXP46100 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRXP46100 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRXP46100 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRXP46100 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRXP46100 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRXP46100 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRXP46100 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRXP46100 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRXP46100 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRXP46100 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRXP46100 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRXP46100 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRXP46100 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRXP46100 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATRXP46100 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATRXP46100 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATRXP46100 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATRXP46100 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATRXP46100 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATRXP46100 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATRXP46100 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATRXP46100 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATRXP46100 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATRXP46100 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATRXP46100 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATRXP46100 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATRXP46100 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATRXP46100 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATRXP46100 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
ATRXP46100 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATRXP46100 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATRXP46100 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATRXP46100 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATRXP46100 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
ATRXP46100 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATRXP46100 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATRXP46100 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATRXP46100 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATRXP46100 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
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