Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms