Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms