Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms