Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HRCP23327 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HRCP23327 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HRCP23327 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HRCP23327 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HRCP23327 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HRCP23327 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HRCP23327 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HRCP23327 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HRCP23327 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HRCP23327 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HRCP23327 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HRCP23327 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HRCP23327 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HRCP23327 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HRCP23327 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HRCP23327 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HRCP23327 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HRCP23327 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HRCP23327 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HRCP23327 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HRCP23327 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HRCP23327 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HRCP23327 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HRCP23327 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HRCP23327 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HRCP23327 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HRCP23327 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HRCP23327 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HRCP23327 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HRCP23327 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HRCP23327 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HRCP23327 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HRCP23327 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HRCP23327 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HRCP23327 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HRCP23327 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HRCP23327 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HRCP23327 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HRCP23327 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HRCP23327 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HRCP23327 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HRCP23327 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HRCP23327 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HRCP23327 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HRCP23327 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HRCP23327 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HRCP23327 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HRCP23327 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HRCP23327 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HRCP23327 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HRCP23327 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HRCP23327 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HRCP23327 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HRCP23327 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HRCP23327 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HRCP23327 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HRCP23327 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HRCP23327 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HRCP23327 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HRCP23327 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HRCP23327 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HRCP23327 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HRCP23327 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HRCP23327 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HRCP23327 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HRCP23327 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HRCP23327 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HRCP23327 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HRCP23327 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HRCP23327 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HRCP23327 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HRCP23327 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HRCP23327 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HRCP23327 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HRCP23327 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HRCP23327 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HRCP23327 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HRCP23327 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HRCP23327 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HRCP23327 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HRCP23327 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HRCP23327 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HRCP23327 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HRCP23327 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HRCP23327 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HRCP23327 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HRCP23327 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HRCP23327 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HRCP23327 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HRCP23327 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HRCP23327 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HRCP23327 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HRCP23327 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HRCP23327 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HRCP23327 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HRCP23327 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HRCP23327 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HRCP23327 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HRCP23327 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms