Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms