Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms