Protein–RNA interactions for Protein: P17096

HMGA1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGA1P17096 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGA1P17096 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGA1P17096 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGA1P17096 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGA1P17096 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGA1P17096 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGA1P17096 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGA1P17096 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGA1P17096 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGA1P17096 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGA1P17096 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGA1P17096 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGA1P17096 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGA1P17096 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGA1P17096 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGA1P17096 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGA1P17096 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGA1P17096 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGA1P17096 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGA1P17096 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGA1P17096 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGA1P17096 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGA1P17096 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGA1P17096 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGA1P17096 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGA1P17096 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGA1P17096 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGA1P17096 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGA1P17096 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGA1P17096 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGA1P17096 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGA1P17096 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGA1P17096 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGA1P17096 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGA1P17096 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGA1P17096 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGA1P17096 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGA1P17096 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGA1P17096 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGA1P17096 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGA1P17096 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGA1P17096 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGA1P17096 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGA1P17096 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HMGA1P17096 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HMGA1P17096 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HMGA1P17096 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HMGA1P17096 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HMGA1P17096 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HMGA1P17096 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HMGA1P17096 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HMGA1P17096 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HMGA1P17096 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HMGA1P17096 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HMGA1P17096 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HMGA1P17096 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGA1P17096 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGA1P17096 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGA1P17096 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGA1P17096 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGA1P17096 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGA1P17096 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGA1P17096 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGA1P17096 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGA1P17096 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGA1P17096 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGA1P17096 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGA1P17096 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGA1P17096 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGA1P17096 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGA1P17096 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGA1P17096 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGA1P17096 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGA1P17096 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGA1P17096 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGA1P17096 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGA1P17096 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGA1P17096 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGA1P17096 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGA1P17096 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGA1P17096 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGA1P17096 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGA1P17096 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGA1P17096 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGA1P17096 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGA1P17096 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGA1P17096 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGA1P17096 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGA1P17096 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGA1P17096 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGA1P17096 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGA1P17096 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGA1P17096 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGA1P17096 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGA1P17096 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGA1P17096 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGA1P17096 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGA1P17096 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGA1P17096 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGA1P17096 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms