Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPB42P16452 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EPB42P16452 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPB42P16452 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPB42P16452 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPB42P16452 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EPB42P16452 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPB42P16452 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPB42P16452 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPB42P16452 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPB42P16452 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPB42P16452 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPB42P16452 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPB42P16452 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPB42P16452 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPB42P16452 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPB42P16452 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPB42P16452 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPB42P16452 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPB42P16452 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPB42P16452 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPB42P16452 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPB42P16452 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPB42P16452 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPB42P16452 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPB42P16452 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPB42P16452 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPB42P16452 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPB42P16452 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPB42P16452 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPB42P16452 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPB42P16452 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPB42P16452 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPB42P16452 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPB42P16452 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPB42P16452 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPB42P16452 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPB42P16452 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPB42P16452 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPB42P16452 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPB42P16452 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPB42P16452 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPB42P16452 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPB42P16452 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPB42P16452 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPB42P16452 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPB42P16452 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPB42P16452 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPB42P16452 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPB42P16452 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPB42P16452 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPB42P16452 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPB42P16452 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPB42P16452 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPB42P16452 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPB42P16452 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPB42P16452 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPB42P16452 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPB42P16452 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPB42P16452 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPB42P16452 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPB42P16452 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EPB42P16452 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPB42P16452 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPB42P16452 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPB42P16452 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPB42P16452 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EPB42P16452 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPB42P16452 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPB42P16452 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EPB42P16452 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPB42P16452 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPB42P16452 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPB42P16452 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPB42P16452 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPB42P16452 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPB42P16452 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPB42P16452 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPB42P16452 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPB42P16452 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPB42P16452 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPB42P16452 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPB42P16452 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPB42P16452 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPB42P16452 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPB42P16452 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPB42P16452 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPB42P16452 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPB42P16452 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPB42P16452 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPB42P16452 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPB42P16452 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPB42P16452 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPB42P16452 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPB42P16452 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPB42P16452 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPB42P16452 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPB42P16452 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPB42P16452 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPB42P16452 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms